Последняя фантазия: Духи внутри

События разворачиваются в недалеком будущем. После падения на Землю метеорита на планете участились случаи внезапной гибели людей. Исследования показывают, что причиной смерти являются сущности, доставленные метеоритом — их называют Фантомами. Предположительно, это души или призраки существ, чья родная планета была уничтожена. Осколок этой планеты, блуждая в космосе, оказался на Земле. При контакте с Фантомом человек погибает.

На Земле сохранились города и поселения, защищенные энергетическими барьерами. Эти барьеры способны сдерживать Фантомов, и внутри них люди продолжают бороться за выживание человечества. Ключевые роли в этом противостоянии играют ученая Аки Росс, доктор Сид и капитан техноспецназа Эдвардс. Центральным конфликтом сюжета является разногласие между учеными и военными: каждая сторона предлагает свой способ ликвидации Фантомов и победы в войне.