Невинная Венера

2010 год. В атмосфере планеты сформировались гиперураганы, нанёсшие значительный ущерб всем странам. Численность населения Земли сократилась с 8 до 3 миллиардов человек. Северная Америка, Россия и северная часть Европы покрылись льдом, равнины ушли под воду, изменив карту мира. Японское правительство создало самостоятельное экономическое государство, опираясь на Технологию Дополнительной Силы (ТДС). Правящий класс, именуемый Логосом, использовал ТДС в военных целях. Малоимущие, которых называли ревенусами, были изгнаны за пределы Особой Экономической Зоны. Европейский союз ЭО и Азиатский союз АО сформировали Единый союз АЭС. Их войска высадились в Кюсю, но были встречены отрядом "Фантом", который подавил атаку. После подписания двустороннего пакта о ненападении с АЭС эти военные силы стали применяться против повстанцев внутри страны.

Спустя некоторое время Джо Кацураги и Джин Цурасава спасаются от отрядов "Фантом", организованных для наблюдения за ревенусами и подавления мятежных элементов Логоса. Вместе с ними скрывается девочка по имени Сана Нобуто. Различные группы и лица проявляют интерес к ней, преследуя собственные цели. Причины этого интереса у каждой стороны различны и не раскрываются полностью в ходе начальных событий.