Югио! Суперслияние — Связь вне времени

В ряде европейских городов происходят разрушения с участием драконов, которые ранее не наблюдались. Среди них отмечаются «Дракон Киберконца» и «Радужный Дракон». Эти события влекут за собой изменения в хронологии человеческой истории. Привычный ход времени нарушается, и последствия затрагивают различные эпохи. В ходе скоростной дуэли Юсэй Фудо сталкивается с незнакомцем, который похищает у него карту «Дракон Звёздной Пыли». Юсэй преследует похитителя и в результате перемещается в прошлое.

Путешествуя во времени, Юсэй встречает Дзюдая Юки. Они договариваются о совместных действиях для противодействия угрозе, исходящей от похитителя карт. Продолжая движение в прошлое, они сталкиваются с Юги Муто, дуэлянтом, известным своими достижениями. Трое персонажей объединяются, чтобы вернуть похищенную карту и восстановить первоначальный ход истории. Для этого они используют свои навыки дуэлей, взаимодействие с картами и взаимную поддержку.